Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 TMEM39A-201ENST00000319172 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 FAAP20-212ENST00000476803 701 ntTSL 215.4■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 FAAP20-214ENST00000497675 4478 ntTSL 212.88□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PSMB6-202ENST00000571309 583 ntTSL 311.92□□□□□ -0.55e-6■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.087e-9■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 ZDHHC14-208ENST00000523468 571 ntTSL 46.82□□□□□ -1.325e-7■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 CNOT7-212ENST00000524358 700 ntTSL 310.14□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 CNOT7-208ENST00000520178 568 ntTSL 510.13□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 LARP1-203ENST00000518194 450 ntTSL 59.55□□□□□ -0.882e-10■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 GAS8-216ENST00000568664 341 ntTSL 59.03□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 FAM133B-211ENST00000494079 854 ntTSL 38.77□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PRR13-213ENST00000552846 407 ntTSL 38.7□□□□□ -1.022e-8■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PFAS-211ENST00000585319 598 ntTSL 38.55□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 GAS8-205ENST00000561675 486 ntTSL 38.42□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 KSR1-212ENST00000580430 483 ntTSL 38.41□□□□□ -1.061e-9■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PSMC2-206ENST00000640277 1357 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PFAS-208ENST00000583059 349 ntTSL 1 (best)7□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PRR13-212ENST00000551945 261 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.97□□□□□ -1.292e-8■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 28
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