Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ETFRF1Q6IPR1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ETFRF1Q6IPR1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms