Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM236Q5W0B7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM236Q5W0B7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms