Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms