Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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