Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms