Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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