Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CKAP5Q14008 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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