Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H3Q13889 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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