Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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