Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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