Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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CHAF1BQ13112 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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