Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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IFT88Q13099 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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IFT88Q13099 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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IFT88Q13099 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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IFT88Q13099 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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IFT88Q13099 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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