Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL28Q13084 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL28Q13084 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms