Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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