Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGNL1Q0VF96 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGNL1Q0VF96 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms