Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms