Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms