Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PGGT1BP53609 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PGGT1BP53609 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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