Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms