Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms