Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XPAP23025 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XPAP23025 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XPAP23025 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XPAP23025 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XPAP23025 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XPAP23025 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XPAP23025 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XPAP23025 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
XPAP23025 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XPAP23025 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
XPAP23025 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XPAP23025 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms