Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFAP13804 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFAP13804 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFAP13804 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFAP13804 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFAP13804 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFAP13804 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFAP13804 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETFAP13804 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms