Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC1P11047 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC1P11047 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms