Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CLDN9O95484 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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CLDN9O95484 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CLDN9O95484 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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