Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMUO75648 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms