Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F6O75461 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F6O75461 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F6O75461 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F6O75461 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F6O75461 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms