Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DXG7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DXG7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B4DXG7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms