Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HDGFL3Q9Y3E1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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