Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms