Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD5Q9P267 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms