Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPJQ9HC77 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPJQ9HC77 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms