Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTN4Q9HB63 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms