Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms