Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms