Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIRIP3Q9BW71 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms