Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms