Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG3Q96JB2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms