Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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