Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35B4Q969S0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms