Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8N402 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8N402 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8N402 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8N402 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms