Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF549Q6P9A3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms