Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSM3Q53FZ2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSM3Q53FZ2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms