Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms