Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Q1T7F1 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Q1T7F1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Q1T7F1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms