Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PTPRNQ16849 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRNQ16849 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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