Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms