Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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