Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
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CNGB1Q14028 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGB1Q14028 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
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CNGB1Q14028 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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CNGB1Q14028 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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CNGB1Q14028 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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CNGB1Q14028 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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