Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms